regulace emisí je centrální vůči argumentu bionafty, zejména v otázkách právních předpisů. Existuje několik složek emisí, které jsou obzvláště škodlivé a způsobit znepokojení mezi vědci, zákonodárci, a spotřebitelů. Síra a jeho příbuzné sloučeniny přispívají k tvorbě kyselých dešťů; Oxid uhelnatý je široce uznávána toxin; a oxid uhličitý přispívá ke skleníkovému efektu. K dispozici jsou také některé méně známé sloučeniny, které vyvolávají obavy, jako jsou polycyklické aromatické uhlovodíky (PAU), ve tvaru prstence sloučenin, které byly spojeny s tvorbou některých typů rakoviny. Pevné částice (PM), má negativní účinky na zdraví, a nespálené uhlovodíky přispívají k tvorbě smogu a ozónu.
Biodiesel dělá snížit nebezpečné emise. Ze současných biopaliv, biodiesel je jediný, kdo má měření emisí byla úspěšně dokončena v souladu se zákonem o ochraně ovzduší
Stihla bionafta emisí ve srovnání s konvenčními dieselovými emisních Component B100 B20 Celkem nespálených uhlovodíků -67% -20% oxidu uhelnatého. - 48% -12% -47% pevných částic -12% NOx + 10% + 2% Sírany -100% -20% -80% -13 PAH% Zdroj: National Biodiesel Board
Navíc, B100 může snížit emise CO2 o 78 procent a snížit karcinogenní vlastnosti motorové nafty o 94 procent (National Biodiesel Board, US DOE Office dopravní Technologies).
Dalším rysem bionafty je to, že je biologicky odbouratelný, což znamená, že je schopna jak důsledkem přirozených látek, jako jsou bakterie. Podle EPA, bionafta degraduje rychlostí čtyřikrát rychleji než konvenční motorové nafty. Tímto způsobem, v případě úniku, vyčištění by bylo jednodušší a následky by nebyly tak děsivé. To by také platit pro směsí bionafty.
Bionafta mohla také snížit americkou závislost na dovážené ropě a zvýšit naši energetickou bezpečnost. Většina bionafty ve Spojených státech je vyrobeno ze sójového oleje, který je hlavní domácí plodina. S námi ropy nároky zvyšují a světová nabídka klesá, obnovitelná paliva, jako je bionafta, pokud řádně prováděna, mohlo zmírnit některé z energetické náročnosti USA.
Bionafta přispívá také k mazivost motoru pro, nebo jeho volnost pohybu. Bionafta působí jako rozpouštědla, která pomáhá uvolnit vklady a další všivák z vnitřek motoru, které by mohly způsobit ucpání. Vzhledem k tomu, čistá bionafta nezanechává žádné usazeniny jeho vlastní, to má za následek zvýšen
