Získávání znalostí
/ Knowledge Discovery >> Získávání znalostí >> technologie >> elektronika >> gadgets >>

Jak Ion Proton sekvencer Works

děpodobné, že sekvencery se stane další velká musíte mít pro všechny přiměřeně velké nemocnice v příštích několika letech. Největší limitující faktory se mohou ukázat jako najít vyškolený personál spuštění testů a interpretaci dat, stejně jako získání souhlasu US Food and Drug Administration pro lékařské použití. Ale budeme o tom mluvit později.

Jak si dokážete představit, firmy čekají, až spolu Life Technologies, aby uspokojili tuto poptávku. Dny před Proton bylo oznámeno, konkurent Illumina vydala své srovnatelný systém, HiSeq 2500 (asi 740.000 dolarů na nákup nové). Zatímco brzy spekulace naznačil, že systém Illumina by mohlo poskytnout čistič čte na jednom testu Proton zdá vítěze v bitvě cenovek [zdroj: Herper]. Ve skutečnosti, teď, že život společnosti vědy, jako je Life Technologies, Illumina a Pacifiku Biosciences dělali lidský genom dostupnější, bude pravděpodobně výbuch sekvencerů v různých cenových kategoriích soutěží o laboratorní prostor mezi výzkumnými pracovníky a zdravotnických zařízení.
Uvedení Proton pracovat

Proton může řešit všechny druhy sekvencování ať už je to DNA-RNA-nebo (ribonukleové kyseliny) na bázi. Life Technologies říká, že stroj je dobrou volbou pro sekvencování následující:

  • Celá transkriptomy, nebo přepis exprimovaných genů v genomu
  • lidského genomu nebo kompletní soubor genetických instrukcí nacházejí v buňce
  • Lidské exomes, oblasti v DNA, které kódují proteiny

    Dříve, sekvenování techniky s nízkým rozlišením povolen pouze vědcům zkoumat malé úseky genetických údajů. Výzkumníci také musel už mít představu o tom, co se snaží najít. S tímto novější generaci sekvencery, jsou schopni zachytit mnohem delší úseky dat. Připraveno rozmotat nějaký? Dvě nejdůležitější ingredience v tomto procesu bude DNA vlákna a čidlo plněné čip sekvenceru je.

    Než budete moci shromažďovat údaje, budete muset připravit vzorku, že jo? Existují systémy pro to. Automatizované ty. Například v době, kdy jsme se psal tento článek, můžete koupit Ion OneTouch systém za $ 14,49 tisíc zvládnout přípravu vzorku ve zhruba čtyři hodiny na protonové předchůdce, stroj Personal Genome.

    Teď jdeme na k čipu. Proton I polovodičový čip je naplněn 165 milionů senzorů, které fungují tak trochu jako ty uvnitř digitálního fotoaparátu. Nad senzory jsou drobné jamky, kde je vzorek DNA sedí. Vzorky se odstřelil s nukleotidy (stavební kameny nukleových kyselin jako DNA). Pokud je nukleotidová se připo

    Page [1] [2] [3] [4] [5] [6]