Výzkum Hodgkinova na penicilin a vitamínu B12 vynesl jí Nobelovu cenu za chemii v roce 1964. V roce 1965 se stala členem Řádu za zásluhy, jeden z Británie je nejvyšší ocenění. Ona byla jen druhá žena být poctěn touto cenou; První byla britská zdravotní sestra Florence Nightingale. Ona také získala dvě ocenění od Královské společnosti: Royal medaili v roce 1956 a Copley medaili v roce 1976.
Hodgkinův další obrátila výzkumného úsilí směrem k inzulinu, což je protein používaný k léčbě cukrovky chorob. S 777 atomů, insulin měla extrémně komplexní strukturu. S pomocí zlepšené počítače, Hodgkinův udělal podrobných výpočtů, které jí dovolil odhalit trojrozměrné struktury inzulínu v roce 1969.
V letech 1960 až 1977, byl Hodgkinův Royal Society Wolfson výzkumným profesorem na Oxfordu EU. Ve svých pozdějších letech, ona cestovala a účastnil se činností na podporu světového míru. V roce 1981, několik kolegů editoval knihu v její počest nazývá strukturální Studie na molekulách biologické zájmu.
Hodgkinův získal Michail Lomonosov Zlatou medaili Ruské akademie věd v roce 1982 a Lenin Prize v roce 1987.
Hodgkinův umřel na mrtvici 29. července 1994, v Shipston-on-Stour, Anglie.