Crowfoot vytvořil techniku určit strukturu cholesterolu jodidu, sterol, který byl první komplexní organický materiál, který má být určen zcela pomocí rentgenové krystalografie. Použití tisíce matematické výpočty, Hodgkin vypracoval schéma molekuly cholesterolu ukazuje hustotu elektronů postižených rentgenového paprsku. Tato mapa hustoty uvedeno, kde se nachází atomy. Ona pak vytvořil umělé krystaly, které byly identické s přírodními kromě toho, že by obsahovaly další atom těžkého prvku. Ona srovnání X-ray fotografie umělých a přírodních krystalů na doplnění chybějících částí struktury krystalu.
Získala doktorát z Cambridge v roce 1937 a pokračoval učit u Oxfordu pro zbytek její kariéry.
V roce 1937 se provdala za Thomase L. Crowfoot Hodgkin, historik. Jejich pracovní místa držel je od sebe během týdne, ale strávili víkendy společně. Pár měl tři děti.
Během druhé světové války (1939-1945), Dorothy Crowfoot Hodgkin se připojil ke skupině vědců, snažících se určit strukturu penicilinu, silný lék používaný k léčbě infekcí způsobených bakteriemi. V roce 1945, Hodgkinův a její kolegové uspěl.
Po druhé světové válce, Hodgkinův pomohl založit Mezinárodní svaz Crystallography. Ona také se připojil několik organizací pracujících pro světový mír. Protože některé z těchto organizací přijatých komunisty v době, kdy americká vláda proti komunismu, Hodgkinův byl někdy omezen na svých cestách do Spojených států.
V roce 1947, Hodgkinův byl zvolen kolegy (člen) královské společnosti , přední vědecká organizace, ve Spojeném království.
V roce 1948 začal pracovat Hodgkinův určit strukturu vitamínu B12. Znalost molekulární struktury vitaminu by vědcům pomoci lépe pochopit, jak tělo používá tuto látku na vybudování červené krvinky a prevenci onemocnění zvané perniciózní anémie, která nastane, když vitamin B12 nemohou být absorbovány v těle. Tato informace by bylo užitečné, aby farmaceutické společnosti, které chtěly produkují chemickou formu vitamínu B12 pro lidi, kteří nemohli nabažit přírodního vitamínu z jejich potravy.
Hodgkinův pustil se do práce s týmem výzkumníků. Pracovala také s Kennethem Trueblood, který vedl skupinu amerických crystallogra-phers na University of California v Los Angeles (UCLA).