Darwin a fylogeneze
Zhruba ve stejné době, kdy Pasteur vyvinul jeho teorii choroboplodných zárodků, Charles Darwin byl představovat jeho evoluční teorii do světa , To by přispělo, co představuje logický plán při hledání prvního života na Zemi. V " O původu druhů, " Darwin reference Sir John Herschell je popis vzniku života na Zemi jako " tajemství záhad " a navrhuje, aby tento druh dnes na zemi nebyly vytvořeny samostatně. Místo toho, oni se vyvinuli ve stále se rozšiřující čísel ze starších druhů přes proces evoluce přirozeným výběrem [Zdroj: Darwin]. V srdci této logice je implikace, že všechny organismy mohly vyvinout z jediného společného předka. To znamená, že moderní vyšetřování vzniku života na Zemi začalo.
Darwinova práce byla postavena na již existujícím systému biologické klasifikaci navrhovanou v roce 1753 švédským biologem Carl von Linné (známého jako Linnaeus). Linnaeus vyvinula taxonomie, systém pro klasifikaci organismů založených obvykle na fyzických zvláštnostech, od nejužšího taxonu (druhy), do skupiny příbuzných druhů (rod) a do stále širšího taxonů až do království rostlin a živočichů (a původně minerálů) [ ,,,0],zdroj: Pidwirny]. Tento systém biologické klasifikace se sám o sobě se vyvinul v průběhu času, s počtem království se rozvíjejících a nejširší taxonu, doménami, ustavený roztřídit buněk jako eukaryotické (obsahující buňky s DNA v jádru), bakterie a archea (doméně extremophiles).
V průběhu času taxonomie stala přesnější, prostřednictvím aplikace genetiky. Tato hybridní pole se nazývá fylogeneze, kde je provázanost organismů je stanovena na základě jejich sdílené DNA. Například, související geny (ty, které plnící podobné funkce) nalezené u lidí a některé druhy myší sdílet stejně jako 90 procent podobnosti jejich sekvencí DNA [Zdroj: Stubbs]. Genetická srovnání šimpanzů a lidí získá asi 95 procent podobnosti [Zdroj: Pickrell]. Tyto podobnosti jsou významné, ale fylogeneze potvrdila to, co Linnaeus, Darwin a bezpočet dalších vědci dlouho postuloval, -., Že každý živý tvor na Zemi souvisí
Systém se používá pro klasifikaci živých věcí, vypadá hodně jako strom, se brzy organismy, které tvoří kořenový systém, a různé taxony zužuje do kufru, velkých větví, menších větví a nakonec do listů, které představují téměř 2 miliony druhů, v současnosti klasifikované vědy [zdroj: O'Loughlin]. Tato reprezentace je často nazýván strom živo