Tento proces, který umožnil, aby se minutu vzorek genetického materiálu a duplikovat dost to pro studium, brzy našel mnoho použití. Vzhledem k tomu, že umožnila rychlou identifikaci a zesílení částí lidského genomu, to hrálo významnou roli v úsilí o zmapování lidského genomu. Vzhledem k tomu, že může přinést množství, které mohou být analyzovány, to dělalo to snazší odhalit infekční choroby organismů, které byly obtížné kultuře. Vzhledem k tomu, že může snadno rozlišit mezi drobnými odchylkami v DNA, to vedlo k novým druhům genetického testování. To se také stalo důležitým nástrojem policejního vyšetřování, protože to může identifikovat osobu, která vlevo kapku krve nebo jednoho vlasy na místě činu. Jeho užitečnost při analýze pravěké DNA navrhl pozemek pro Michaela Crichtona knihy a později Steven Spielberg film Jurský park, ve kterém vědci duplikovat dinosauří DNA extrahované z komára uchovaný v jantaru. To může také pomoci učenci dát dohromady tisíce částic pergamenu z Mrtvého moře roluje.
V roce 1986, odešel Mullis Cetus. Společnost mu nevěnoval pouze $ 10,000 bonus pro jeho vynález. Později, DuPont je nadnárodní farmaceutická společnost, žaloval Cetus přes patentového sporu tvrdí, že DuPont chemik měl vlastně vynalezl PCR v roce 1970. Cetus musel ustoupit požadavek Mullise k vynálezu nebo riskujete patent, který se ukázal vysoce ziskové. Když farmaceutický gigant, Hoffmann-La Roche koupila patent od Cetus v roce 1991, to zaplatil Cetus světově rekordní $ 300 mil.
Poté, co pracoval od roku 1986 do roku 1988 v Xytronyx, Inc., Mullis stal volné noze poradce , Méně než rok poté, co se stal laureátem Nobelovy ceny, Mullis byl zakázán od mluvení na zasedáních Evropské společnosti pro klinické zkoušky, jedna z předních evropských lékařský výzkumnými organizacemi, a obvinil prezidentem společnosti ze podkopává hodnotu výhry. Netrvalo dlouho, to bylo široce připustil, že Mullis je alespoň jeden z nejvíce nekonvenční osob, kdy byla udělena Nobelova cena za chemii. Jeho 1998 Dancing nahý ve Mind Field, kniha esejů, odhalil ho, aby byl zastáncem astrologie a věřící v cizí únos.
Ačkoli kritizovaný vypovídat jako soudní znalec v 1995 OJ Simpson
