Watson a Crick dostal nějakou pomoc s jejich šetření, z Rosalind Elsie Franklinová, britský fyzikální chemik a spolupracovníka Wilkins na královské vysoké škole v Londýně. Watson a Crick se snaží přes tvaru korupcí, kdy byl Watson znázorněno rentgenové difrakce vyrobený Franklin, který jasně ukázal, že struktury DNA bylo, že šroubovice. I když tato fotografie se ukázalo rozhodující pro Watson a Crick je objev, Franklin byl nevědomý, že ji viděl. Zemřela na rakovinu v roce 1958 a Watson nabídl opožděný uznání příspěvku Franklina v jeho knize Double Helix. Watson a Crick hlášeny své výsledky ve dvou článků publikovaných na jaře roku 1953. První článek byl doprovázen ilustraci šroubovice, tažené Cricka manželkou, Odile.
Později v roce 1953, Watson přijal místo vedoucí vědecký pracovník v biologii na California Institute of Technology, Pasadena, Kalifornie. O dva roky později byl jmenován docentem biologie na Harvardské univerzitě, kde byl jmenován docentem v roce 1958 a profesorem v roce 1961. O sedm let později, Watson stal ředitelem Cold Spring Harbor Laboratory v Cold Spring Harbor, Long Island, New York, zatímco ještě zůstane na fakultě na Harvardu. Pokračoval s touto dvojí povinnosti až do roku 1976, kdy odešel na Harvard věnovat všechny své síly do Cold Spring Harbor.
Vzhledem k tomu, za předpokladu, že vedení na Cold Spring Harbor, Watson podporoval výzkum v oblasti nádorové virologie a tento řádek o vyšetřování vedla vědce k lepšímu porozumění genů rakoviny. Watson také zdůraznil, vzdělání a rozšířil nabídku třídy laboratoře pro pokročilé studenty v molekulární biologii i střední a vysoké školy. Podporovat jeho vzdělávací cíle, založil stupeň-udělovat instituci, Cold Spring Harbor Laboratory Watson škola biologických věd. V roce 1994 se stal prezidentem Cold Spring Harbor Laboratory, tuto pozici si stále drží. Jako prezident, on pomáhal průvodci obecnou politiku pro zařízení.
V roce 1988, Watson se stal asistentem režie, ao rok později ředitelem, z Národního centra pro projekt lidského genomu z National Institutes of Health (NIH ). Zatímco dohlíží na projekt, on vyčleněna malá část finančních prostředků studovat etické problémy vyplývající ze zjištění projektu. V průběhu svého funkčního období, Watson měl
