Tatar dobytí bylo katastrofální pro Persie. Velká část mužské populace byl zabit, a celkový počet obyvatel země se snížil téměř o čtvrtinu. Ekonomika byla ponechána v troskách, a mongolští daně držel lidi ochuzený a zabránit obnovení.
Přestavba Persie začala se vstupem Ghazan Khan na trůn v roce 1295. Aby mongolského pravidla přijatelnější Peršanům, on konvertoval k islámu a obnovit perské úředníky na pozice autority. S jejich pomocí, on kodifikoval zákony, snížené daně, přestavěný a rozšířený zavlažování pracuje na zvýšení zemědělské produktivity, a dělal cest přívěsu bezpečné podpořit obchod. Italské obchodní kolonie v Persii otevřel obchod s oblastí Středozemního moře. Shiraz, v blízkosti místa Persepolis, se stal centrem literatury a umění. S čínského vlivu zavedené Tatarů, vynikající keramiku a iluminované rukopisy byly vyrobeny.
V roce 1335 Il-chán říše splintered do množství prakticky nezávislých států. V roce 1381 Tamerlane (nebo Timur), muslim potomek Tatarů a vládce Samarkandu, podmanil Persii a vytvořil velké říši. Jeho nástupci, tím Timurids, vládl až do roku 1500, kdy Peršané získal kontrolu.
Persii jako nezávislý stát
vůdce pod kým Peršané svrhli Timurids byl Ismail, zakladatel dynastie Safawid. On obnovil perskou království, dosahující až Oxus na severovýchodě a Eufratu na západě. Rostoucí síla pohovek, nicméně, vedl k častým pohraniční konflikty. Shah Abbas (I) velký (vládl 1586-1628) přesunul jeho kapitál do vnitrozemí Isfahánu. Vedl Peršany ve válce proti Turkům, 1602-18, ve kterých Turci byli zatlačeni zpět a Persie získal nové území na severozápadě.
Portugalsko zmocnili perský přístav v roce 1555. I když starém karavanu trasy ztracené význam poté, co námořní trasy byla otevřena kolem mysu Dobré naděje, byly perské přístavy dobrou polohu pro rozvíjející se obchod mezi Evropou a Indií. V roce 1622 anglické a nizozemské pomáhal Persii donutit Portugalce ven, a Anglie se stal hlavním vlivem v Perském obchodu.
V roce 1638 Mezopotámie byl trvale připojen Osmanské říše. Na počátku 18. století Afghánci vyhlásil jejich samostatnost a začal zabírat východní Persie. Ruští kozáci dělal nájezdy na Kavkaz. V roce 1736 provinční guvernér, Nadir Shah, chytil kontrolu království. Odsunul Rusové a Turci, dobyl znovu Afghán
