Stejně tak, kukuřičný ethanol nemusí být tak šetrný k životnímu prostředí, protože většina lidí myslí. Pokud rafinérie otočil každý klas kukuřice ve Spojených státech na etanol, by nahradit pouze 12 procent benzínu [zdroj: Brune]. Zemědělci používají mnoho fosilních paliv růst a procesní etanolu z obilovin, což způsobuje zvýšení emisí skleníkových plynů. Z farmy na plynovou nádrží, kukuřičný etanol vyrábí jen 15 procent méně skleníkových plynů v atmosféře, než ekvivalentní množství benzínu [zdroj: Tillman a Hill].
Některé biocrops může také negativně ovlivnit divokou zvěř. Vědci z University of Wisconsin-Madison říkají, že počet druhů ptáků v horní Midwest by mohla snížit mezi 7 a 65 procent, pokud se zemědělcům rostlin kukuřice a další roční energetické plodiny. Vědci tvrdí, že mnoho druhů, včetně ptáků, jako žít v oblastech s různými flóry. Výsadba řadové plodin ve velkém měřítku, jako je sója a kukuřice, by se snížil ptačí biodiverzity, říkají [Zdroj: Tenenbaum].
Odborníci tvrdí, že pokud se rozhodneme naše energetické plodiny moudře, mají potenciál poskytnout svět s energií šetrné ke klimatu. Ale milionů dolarů otázka je opravdu, které biocrops bychom měli pěstovat, a kde bychom měli pěstovat?