Získávání znalostí
/ Knowledge Discovery >> Získávání znalostí >> věda >> life science >> buněčná biologie mikroskopické >>

Jak microbiome projekt lidského Works

obiomem a vyvíjet referenční sady mikrobiálních analýza sekvencí nukleotidů (cílem bylo 3.000 sekvence). Druhá fáze (2013-2015) zahrnuje rozvoj druh katalogu microbiome datových souborů na pomoc vědecké výzkumné obce a studijní nemoc a zdraví. Mají také širší, náročný úkol vyšetřovat spojení mezi osoby mikrobiální komunity a různých onemocnění a stavů.

Proč se tak nestalo již dříve? Technologie neexistoval. Tam opravdu nebyl způsob, jak vědci studovat obyvatele microbiome protože nemohli být pěstovány nebo izolovat v laboratorním prostředí. Ale s předstihem sekvencování DNA a technologie, vědci byli nyní schopni izolovat genetický materiál z mikrobiálních společenství, aniž by musel pěstovat [zdroj: NIH]. A tak začal projekt v roce 2007 s rozpočtem ve výši 170 mil $ a poměrně jednoduchým úkolem:. Odebírání vzorků z dostatečně velké množství zdravých lidí k určení směrného nebo rámec toho, co člověk microbiome znamená

První fáze začala nábor dobrovolníků, kteří byly považovány " zdravé &Quot.; To nebylo jednoduché: 600 subjektů mezi 18 a 40 byly přineseny dovnitř, ale po rigorózních zkoušek (pro věci, jako dutin a kvasinkových infekcí, jakož i celkový zdravotní stav), více než polovina byly zamítnuty. Dvě stě čtyřicet dva vyučovací předměty z Houstonu v Texasu, a St. Louis, Missouri, konečně splnila kritéria, a byly ty šťastné, které mají být setře více místech v různých časech, a pak se jejich biome sekvenovány více než 200 vědců v 80 různých institucí [zdroj: Kolata].

Každý muž byl odebrán vzorek na 15 místech, a každá žena v 18 (k účtu pro mikrobiální prostředí pochvy), každá až třikrát více než dva roky. Vzorky součástí oblastí střeva (převzato ze stoličky), nos, a více místa v ústech a na kůži

V průběhu studie, více než 11.000 vzorků byly získány, a vědci. byli schopni k sekvenci část RNA materiálu identifikovat mikroby, jakož i určit velikost populace [zdroj: Baylor College of Medicine]. Dosud, 800 vzorků prošel celou genomové sekvence [Zdroj: Baylor College of Medicine]. Projekt vyvolal neuvěřitelných 3,5 bilionů bajtů dat, což je tisíckrát více, než projektu lidského genomu [zdroj: Baylor College of Medicine].

National Institutes of financování Common-zdravotního fondu bylo použito přes 2013 , ale projekt pak začala financovat sama přes 16 zúčastněných NIH instituty [Zdroj: Mole]. Vědci stále ještě jsou, kterým se stanoví přísnější protokoly o odběru vzorků, a pokoušet se najít základnu technickou

Page [1] [2] [3] [4] [5]