Další velký problém spojený s odpadními vodami zavlažování půdy a znečištění vody. Bakterie v potravinářském a vody se může stát trvalé, rozšířený problém, kdy se odpadní voda přelije přes orná půda kontaminuje jinak bezpečné podzemní a povrchové vody používané k pití.
I přes tato rizika, a to jak Mezinárodní vodohospodářský ústav a kteří věří, výhody odpadních vod zemědělství daleko převažují nad nevýhodami [zdroj: Eichenseher]. Bez ní, více zemědělců v rozvojových zemích by mít žádný příjem, a více lidí bude mít žádné jídlo. Ale tyto světové organizace přece mají doporučení pro provádění v praxi bezpečnější, než je teď.
Za prvé by to pomohlo, kdyby další místní zemědělci přijala domorodých metod čištění vody, jako je rybník-usazování a kompostování. Další zdravější praxe by omezující odpadních zavlažování použít u plodin, které se v konečném důsledku bude vařených pro spotřebitele, jako je rýže a jiných zrn. Hodně to závisí na vzdělání, což je nakonec způsob, jak zdravotní problémy, odpadní vody budou muset řešit, protože ve většině případů, jen zcela úpravu vody není možné. Zatímco většina zemědělců, kteří musí používat odpadních vod vědět, že je to nezdravé, nemusí vědět o způsobech, jak omezit riziko za rozumnou cenu. Rozšířené úsilí vzdělávat domorodé obyvatelstvo o jednoduchých metod léčby a bezpečnější rozhodnutí plodin může pomoci snížit nebezpečí, jimž čelí 10 procent na světě, která se opírá o odpadních plodin pro výživu.
A co zbývajících 90 procent svět?
Vzhledem k tomu, tolik produkovat pohybuje po celém světě, je tu vždy možnost být vystaveni vyrábět zavlažované s odpadní vodou, i když žijete v rozvinuté zemi s vysokými standardy vody. Ve Spojených státech, například, mnoho zeleniny jsou dováženy z Mexika, a mnoho oblastí v Mexiku nejsou čistit odpadní vody, než se zaplaví
