Boone v Missouri
Ještě před Kentucky byl přijat jako stát v roce 1792, jeho země se stala cenná. Boone položil požadavek na řadu tiskovin v Kentucky; jeho nároky nebyly nikdy správně registrován, nicméně, a on nakonec ztratil všechny země si myslel, že byl jako jeho. V roce 1788 on a jeho rodina usadila v čem je nyní Západní Virginie. Přestěhovali se do Missouri (pak španělském území) v roce 1799, usazovat na španělské postoupení pozemku blízko St. Louis.
Boone byl jmenován soudce jeho obvodu v roce 1800, a sloužil až do území bylo postoupeno do Spojených států státy v roce 1803. Znovu ztratil tituly do své země. On pokračoval tvrdě pracovat, nicméně, a v roce 1810 byl schopen vrátit se do Kentucky splatit nějaké staré dluhy, které ho trápí. To ho nechal téměř bez peněz.
Booneova manželka zemřela v roce 1813. V roce 1814 Kongres obnoven jeho držení se mu uznání za jeho služby do země. Boone a jeho manželka jsou pohřbeni ve státním hřbitově u Frankfort, Kentucky.
Boone je jmenován jako autor objevu, vypořádání, a současný stav Kentucke (1784), ale kniha byla napsána John Filson, učitel. Neexistuje snad žádný základ pro příběhu, který strom ještě stojí nese nápis "D. Boon cilled bar na tohoto stromu."