Většina osadníků byl vyhnán od Sioux, ale v roce 1858 Yankton Sioux podepsal smlouvu. Oni postoupil všechny jejich země mezi Big Sioux a Missouri do Spojených států, s výjimkou 400.000 akrů (162.000 hektarů). Když Senát ratifikoval smlouvu v roce 1859, několik set osadníků přesunula do nově otevřeného regionu.
Osadníci rychle nastavit svůj vlastní vládu a požádal Kongres, aby založit nové území. Kongres schválil účet vytvářet Dakota území, a prezident Buchanan podepsal dne 2. března 1861. Území zahrnovalo všechny současné Severní a Jižní Dakota a části Montana a Wyoming. Yankton bylo dělal územního kapitálu. Montana byla dělal oddělené území v roce 1864, Wyoming v roce 1868.
Gold Rush a indické trable
Během roku 1860 v osadě nové území, byl pomalý, protože občanské války a strach z Indů odradit přistěhovalectví. Sioux povstání, které začalo v Minnesotě v roce 1862 rozšířil do Dakoty, což způsobuje dočasné upuštění od většiny měst. Další problémy s Sioux vedly ke smlouvě o Laramie 1868, kterým celá západní polovina současného Jižní Dakoty byl dán do Sioux jako rezervace. Tato oblast byla uzavřena pro všechny bílé.
V roce 1874, v reakci na pohybování bělochů, kteří chtěli otevřít prostor k vypořádání, podplukovník George A. Custer bylo nařízeno, aby vedl vojenskou výpravu, aby prozkoumala Black Hills , část pozemků Sioux. Vzhledem k tomu, strana byla skauting Black Hills, to objevil zlato na French Creek, poblíž dnešního města Custer. Když se zpráva o objevu dosáhl východní města, horníci začali hrnout do regionu. Mnoho důlní tábory byly stanoveny v krátkém čase, včetně Rapid City, Deadwood, a olovo. Zlaté horečky také přinesl železnice k Dakota území.
Bílé vniknutí do Black Hills, posvátný pro indiány, vedl k Sioux války 1876. Většina z Sioux vzdala po krátké době a podepsal mír smlouva, kterou se vzdali Black Hills a dohodla se přestěhovat do rezervace, které byly blíže k řece Missouri. Na oplátku, vláda přislíbila poskytnout dávky, dokud indiáni byli schopni se uživit.
