Během sil občanské války Konfederace napadl New Mexico brigádního generála Henry Hopkins Sibley v roce 1862. Vítězná na Valverde, vzal Albuquerque a postoupil k Santa Fe, ale byl vyhnán Union sílami po jeho výdej ve vlaku byla zničena v bitvě u Glorieta. Plukovník Kit Carson porazil Mescalero Apaches v roce 1863 a Navahos v roce 1864. The Navahos dostaly svou současnou rezervací v roce 1868. Problém s Apači pokračoval do 1880, zejména v rámci jejich schopným šéfem Victorio.
Rozšíření sortimentu dobytek průmyslu po občanské válce dosáhl New Mexico v roce 1866, kdy Charles Goodnight a Oliver Loving řídil stádo dobytka Texas Fort Sumner nad tím, co přišlo být nazýván Goodnight Loving-Trail. Éra dobytka baronů byla doprovázena hodně bezpráví, kulminovat Lincoln krajská válka, 1878-81, krvavé rozsah války v jižním Novém Mexiku mezi dvěma soupeřícími frakcemi farmářů a obchodníků. (Billy the Kid hrál významnou roli ve sváru.)
příchod železnic v roce 1880 pomohl jak dobytek a důlní průmysl a také přinesl mnoho "Anglo" (non-indický, non-Hispánská) zemědělce, aby v Novém Mexiku.
státnosti
New Mexico snažil státnost již v roce 1849, ale politické a jiné faktory opožděné přijetí. Ústava byla přijata a státní zřídila vláda v roce 1911, a 6. ledna, 1912, Nové Mexiko byl přijat do Evropské unie jako 47. stát.
Pancho Villa vpadl Columbus v roce 1916, a trestnou výpravu brigádního generála Johna J. Pershing vykonával svou kapelu do Mexika.
S výstavbou Los Alamos National Laboratory během druhé světové války, Nové Mexiko se stala centrem pro jaderné zbraně, výzkum a vývoj. Jako první na světě atomová bomba byla explodovala dne 16. července 1945, na White Sands Proving Grounds poblíž Alamogordo. expanzi průmyslu , která začala krátce po válce, pokračovaly v roce 1950, jak byly objeveny uran a ropná ložiska.
V roce 1960, aliance mexických Američanů agitoval pro navrácení pozemků pod starými španělských pozemku. Jejich tvrzení nebyla potvrzena. V roce 1970, nicméně, federální vláda se vrátil do Taos Indů 48.000 akrů (19.000 ha) půdy odebrané z nich na počátku století a začleněn do Carson národní les.
v roce 1970 v Novém Mexiku se stala významným dodavatelem uhlí, zemního plynu, ropy a uranu se zbytkem země. Celonárodní recese brzy 1980 způsobilo vážné ekonomické problémy ve stavu; obzvláště zasaženy byly zemědělství, farmaření, a h