Retroviry spoléhat na bílkoviny katalyzátor s názvem proteáza as součástí jejich reprodukční proces. Inhibování že bílkoviny hodí univerzální klíč do retroviru strojů ničení. Skutečně, tyto inhibitory proteázy se již používá k léčbě HIV infekce u pacientů s AIDS [zdroj: Britannica].
Bohužel, česání se struktury takových proteinů je jedním z nejobtížnějších hlavolamů známe. Představte si, že plnění obří krabice s zamotaný vánoční stromky, nepoužívaných Slinky hračky, ostnatý drát, lepicí pásky a elektromagnety, pak třásla a otáčíte kolem, a nakonec se snaží uhodnout, co tvar, který udělal. Ty jsem jen začal poškrábat povrch složitosti tohoto úkolu. Proteiny se může skládat z více než 10.000 atomů za kus, tvořit řetězce, dílčí řetězy a dluhopisy v nesčetných kombinací; Ve skutečnosti existuje více způsobů, jak složit bílkovin, než tam jsou atomy ve vesmíru [zdroj: Bohannon].
Tato složitost je více než dokonce superpočítač může někdy zvládnout, zejména proto, že počítače nejsou zvláště dobré na pracuje s trojrozměrnými tvary. Takže vědci začali hledat rychlejší a účinné prostředky k praskání proteinové struktury. Jejich řešení? Použijte vrozené prostorové analýzy schopnosti lidského mozku. Foldit se narodil. Téměř okamžitě začal platit dividendy.
V této další části se budeme se blíže podívat na to, jak Foldit funguje, co hráči dosáhli s ním, a zda nebo ne oni vyléčen HIV.
Molekulární Clockwork
Nezbytnou součástí hodinářského řemesla skládá z montáže sbírku jemných součástek v tak kompaktní prostoru, jak je to možné, a zároveň zajistit, aby omezeném prostoru nejsou v rozporu s funkcí Hodinky se.
V Foldit, hráči použít jednoduché okno nástrojů manipulovat tvar proteinu. Myšlenka je ohýbat, kroutit, pohybovat a třást proteinu v postranních řetězcích a aminokyselin skelety, tak, že se celá struktura je zabalena do optimální podoby. Hráči vědí, že jejich řešení funguje, když se zbavit kolizí mezi postranních řetězců atomů, skrýt hydrofobní řetězce uvnitř proteinu, tváří v tvář hydrofilní řetězy směrem ven a odstranit velké prázdné prostory, které ohrožují stabilitu proteinu - to vše se odráží v Jejich skóre.
skóre, společně s pravidly pro povolené tahy, pochází z fyziká
