S kolegou, Cooper vyvinul softwarový systém, který by mohl rozpoznat a přeměnit ručně psané dopisy do napsaných znaků. International Business Machines Corporation (IBM) představila systém v roce 1987.
V roce 1991, Cooper se stal prvním ředitelem Institutu Brown University pro mozek a Neural Systems. Institut sdružuje matematiky, psychologové, inženýři, fyzici, lingvisté, počítačové vědce, biology a ke studiu fungování mozku a nervové soustavy vyšších zvířat, včetně lidských bytostí.
Cooper byl oceněn sedmi čestný stupňů. Je členem Americké akademie umění a věd, American Physical Society, Národní akademie věd, americké filozofické společnosti, a sponzorem Federace amerických vědců. V roce 1968, spolu s Schriefferem, mu byla udělena Comstock Cenu Národní akademie věd.
