Druhá světová válka (1939 - 1945), přerušil Menzela akademickou kariéru. Od roku 1942 do roku 1945, jako velitel, on sloužil v americkém námořnictvu a učil kryptologie, který zahrnuje vytváření a překládání zpráv na tajný kód. On také dělal výzkum o vlivu sluneční aktivity na rádiových vln komunikace a rozhlasové propagace. Válka prokázala hodnotu rádiové komunikace a vliv sluneční aktivity na něm. Poté, Menzel pomohl US Air Force zřídit observatoř na Sacramento Peak blízko Alamogordo v Novém Mexiku.
Menzel nadále zejména fascinován zatmění slunce, a on vedl zatmění výpravu na Sibiř v roce 1936. On cestoval glóbus a byl svědkem více než tucet zatmění Slunce v jeho celém životě.
A plodný autor, zatímco pracuje na svém doktorátu v Princetonu pomohl živit se tím, že píše sci-fi příběhy. Později v životě, on byl redakční poradce různých periodikách, včetně Galaxy Magazine, sci-fi časopisu. Přes jeho zájem o science fiction, nicméně, on napsal tři knihy odhalovat UFO a vizitace mimozemskými bytostmi. Tvrdil, že takové jevy byly výsledkem buď projevů různých přírodních jevů nebo optický klam.
Menzel pomohl popularizovat pole astronomie. Napsal několik knih směřující k široké veřejnosti, včetně Polní průvodce hvězd a planet (1964), populární příručka pro začínající astronomy a naše Slunce (1949), standardní reference na toto téma.
Spolu s jeho akademické kariéře, Menzel také sloužil jako konzultant pro různé vládní a vojenské organizace. On byl blízko obeznámený s prezidentem Johnem F. Kennedym, což odpovídá často se s ním během předsednictví Kennedyho o různých politických a vědeckých otázkách. 
[1] [2]