Baer je studie embrya, aby vedl k jeho odhalení a popis funkce jiných obratlovců struktury, včetně chorion, což přispívá k tvoření placenty a notochord, je podlouhlých šňůra buněk, která podporuje strukturu obratlovců embryí. Poukazuje na to, nervové záhyby v notochord, Baer Navrhovaný thatthey jsou počátky nervového systému.
V roce 1834, Baer přestěhoval do Petrohradu, Rusko. On se stal řádným členem Akademie věd a zastával řadu administrativních pozicích. Ačkoli on dělal žádnou další-embryologické výzkumu, on pokračoval přispět k vědě jako přírodovědec. Udělal expedic na řídce obydlené severu Ruska, z níž shromažďují vzorky. Island Tam byl jmenován v jeho cti. Baer používal jeho měření lebky exemplářů: jako základ pro práce ve kterém on se navrhované všechny lidské lebky mohl mít původ v jednom typu. Tato práce, které publikoval v roce 1859, stejný rok jako Charlese Roberta Darwina Původ druhů. V roce 1861, Baer uspořádal setkání craniologists (vědců specializující se specializovat v lidských lebek) v Německu. Toto setkání vedlo k založení německé antropologické společnosti. Baer, co tak pomocný v založení ruské geografické společnosti a ruské společnosti entomologické. Kromě toho jsou síly za Baer vysvětleno charakteristické konfiguraci ruských říčních břehů. Jeho vývoj ryb (1835) Povzbuzen nové zájmy, a to jak vědecké a ekonomické, v ruských rybolovu.