Občanské války a po
Na vypuknutí občanských Válka, Frmont byl pověřen generálmajor dobrovolníků a daný rozkaz odboru Západu, se sídlem v St. Louis, Missouri. On byl odstraněn prezidenta Lincolna poté nařídil, bez povolení, uvolňovat otroků v Missouri, státní hranice, který nebyl vystoupil ale tam, kde byly vysoké napětí. V roce 1862 mu bylo svěřeno velení menší význam v západní Virginii, ale ukázala jako neúčinná v oponovat Shenandoah kampaň Konfederace. On vzdal se jeho hodnosti brzy po.
Radikální republikáni nominován Frmont na prezidenta v roce 1864, ale on ustoupil. Po občanské válce, Frmont ztratil jeho bohatství přes neúspěšném železničním podniku. Prezident Hayes ho zachránil z chudoby by jmenovat jej guvernérem Arizona území, kterou zastával v průběhu 187883. paní Frmont také pomáhal s financemi od psaní článků pro různé publikací. Těsně před Frmont zemřel, prezident Harrison jej obnovit do armády jako ve výslužbě generálmajora s plat.