V brzy 1900 je více než polovina z Mississippi populace byla černá, ale černoši byli popřel hlasovat přísně uplatňovaly požadavku gramotnost-testu v 1890 ústavě. Jeden z nejúspěšnějších politických vůdců státu bylo Theodore Bilbo (1877-1947), který se ucházel o úřad na platformě bělošské nadřazenosti. On sloužil jako guvernér dvakrát před odesláním do Senátu USA v roce 1934, kde zůstal až do své smrti.
1960 černochů již tvořily většinu dospělé věku pro právo volit, ale pohyb se zaregistrovat pro černochy Hlasování se setkal s jednotným odporem. V roce 1962 federální soud nařídil University of Mississippi zapsat James Meredith jako první černý student. Vzdor řádu byla vedena guvernérem Ross Barnett, a vážná vzpoura vypukla na univerzitě. Federální vojáci byli potřeboval pomoc Meredith vstoupit na univerzitu. Další rasově motivované násilí zahrnovaly vraždu roce 1963 civilní vůdce práva Medgar Evers, a v roce 1964 ze tří pracovníků občanských práv.
V polovině 1960, účast černochů v politice zvýšil. V roce 1969 Charles Evers, Medgar bratr, byl zvolen starostou Fayette-první černý starosta s míšenci města Mississippi od Reconstruction. Také v pozdní 1960, bílá opozice vůči integraci veřejné škole vedl rasových nepokojů. Tím, brzy 1970, soud nařídil desegregaci státních škol na všech úrovních byla v plném proudu.
V roce 1969 se kapela Mississippi Choctaw Indů otevřel stavební firmu na výstavbu domovů pro členy kmene. Tím se výrazně zvýšilo bohatství skupiny a udělal tuhle kapelu jedním z nejlepších zaměstnavatelů ve státě.
V pozdní 1980, legislativa se odehrála na reformu vlády kraje a zvýšit finanční prostředky na vzdělání. Voliči zvolen prvním republikánského guvernéra od Reconstruction, Kirk Fordice, v roce 1991.
V časném 2000s, konstrukce státní vlajce, která byla přijata v roce 1894, se stala tématem diskuse, protože roh zobrazí občanské války emblém Confederate států; Afroameričané a jiní namítali, protože symboliky spojené s otroctvím. Guvernér jmenován komise navrhla novou podobu, ale v roce 2001 voliči odmítli nový design ve prospěch verze 1894.
hurikán Katrina udeřil na pobřeží Mexického zálivu v roce 2005 a způsobila vážné škody. Zvlášť těžké hit byla oblast kolem Biloxi a Gulfport.
